6月29日，生态环境部环境监察局局长田为勇在生态环境部6月例行发布会上通报了黑臭水体专项行动第一批督查结果：第一批督查发现，截至2017年12月底，广东、广西、海南、上海、江苏、安徽、湖南、湖北等8省(直辖市)20市上报共有黑臭水体525个，均已列入国家清单，地方上报已完成整治458个。经督查组现场检查判定，其中34个为未消除黑臭，占7.4%。9个城市存在上报已完成整治但仍未消除黑臭的水体，分别为：南宁11个，十堰9个，东莞5个，深圳3个，武汉2个，广州、芜湖，岳阳和随州各1个。

现场督查发现，一些地方存在尚未向国家上报的黑臭水体，包括：广州102个、深圳80个、无锡18个、扬州14个、东莞12个、上海11个、芜湖2个，南京、武汉、随州各1个，共242个。

现场督查发现，黑臭水体治理主要存在以下问题：

控源截污不到位。督查期间发现存在控源截污不到位方面的问题共分5大类，190个，涉及92个水体。主要体现在存在非法排污口、城镇污水管网不配套、污水处理能力不足、截流的污水未经处理异地排放、雨污合流等方面。底泥污染未得到有效解决。督查期间发现14个城市41个黑臭水体重污染底泥未得到有效清除，69个黑臭水体清理出的底泥随意堆放。沿河倾倒垃圾问题突出。现场督查发现36个黑臭水体河面存在大面积漂浮物，64个黑臭水体河岸存在大量随意堆放的垃圾。

针对上述问题，田为勇表示，生态环境部将印发督办函，将专项督查期间发现的问题移交地方，要求限期整改并向社会公开，实行“拉条挂账，逐个销号”式管理。

5月下旬起，对北京等11省(直辖市)26个城市的黑臭水体整治情况开展了第二批督查。目前，正在对辽宁等11省(区)24个城市的黑臭水体整治情况开展第三批督查。